Study/Paper Summary

[Article] AmpliCI: 새로운 ASV method

2021. 2. 15. 10:02

정리

  • Model에 대한 설명은 Materials and Methods에 수식과 함께 정리되어 있다 (이해 못함...)
  • DADA2, Deblur, UNOISE3와 같은 ASV method로 개발된 방법인데, 위 3가지 방법보다 더 나은 퍼포먼스를 보인다고 소개함.
  • UNOISE3와 Deblur는 quality information을 무시하는 반면, DADA2와 AmpliCI는 quality information을 사용한다.

 

Reference

  • Peng, Xiyu, and Karin Dorman. "AmpliCI: a high-resolution model-based approach for denoising Illumina amplicon data." Bioinformatics (2020).

 

 

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