[Article] Amplicon data를 이용한 Functional profile 예측 향상 (Meta-Apo)

정리

• 위 논문은 Meta-Apo라는 tool을 개발함.
• 기존 PICRUST2 같은 프로그램도 16S rRNA gene amplicons를 이용하여 funtional profile을 예측 가능했지만, 정확도가 낮았다.
• Meta-Apo는 같은 microbiome speciment에서 유래한 shotgun WGS와 16S-amplicon 데이터를 학습시켜서, amplicon data로부터 더 정확한 functional profile을 도출할 수 있는 프로그램이다.

 

Reference

• Jing, G., Zhang, Y., Cui, W. et al. Meta-Apo improves accuracy of 16S-amplicon-based prediction of microbiome function. BMC Genomics 22, 9 (2021). [링크]