[용어 설명] Exon, Intron, coding region (CDS), Open reading frame (ORF)

먼저 exon, intron, CDS의 관계는 다음과 같이 정리될 수 있다.

DNA로부터 전사를 통해 precursor mRNA (pre-mRNA)가 생성되면 RNA splicing을 거쳐 mature mRNA가 된다. 이때 introns는 잘려나가고 exon만 이어붙는다 (1).

이때 단백질을 코딩하는 부분을 coding region 혹은 CDS (coding sequence)라고 부른다 (2).

즉, exon은 단지 splicing pattern을 나타내며, CDS는 exon 중간에서 exon 중간까지 이어질 수 있다.

 

Open reading frame (ORF)이란 단백질로 번역될 수 있는 부분 (시작 codon + 종결 codon)을 말하며, 이 중에서 실제로 단백질로 발현될 수 있는 부분이 CDS이다 (3).

 

Reference

1. https://en.wikipedia.org/wiki/RNA_splicing
2. https://en.wikipedia.org/wiki/Coding_region
3. https://en.wikipedia.org/wiki/Open_reading_frame