[Article] GMrepo: 사람의 장내미생물 데이터베이스

정리

• Human gut metagnomes를 정리한 데이터베이스.
• 253 projects로부터 58,903개의 샘플 (17,618 metagenomes과 41,285 amplicons)을 분석하여 92 phenotypes과 microbes간의 관련성을 확인할 수 있도록 함.
• 각 taxon이 특정 phenotype에서 어떻게 분포되었는지, 어떤 marker로서 기능할 수 있는지 알 수 있다.

 

Reference

• Sicheng Wu, Chuqing Sun, Yanze Li, Teng Wang, Longhao Jia, Senying Lai, Yaling Yang, Pengyu Luo, Die Dai, Yong-Qing Yang, Qibin Luo, Na L Gao, Kang Ning, Li-jie He, Xing-Ming Zhao, Wei-Hua Chen, GMrepo: a database of curated and consistently annotated human gut metagenomes, Nucleic Acids Research, Volume 48, Issue D1, 08 January 2020, Pages D545–D553, https://doi.org/10.1093/nar/gkz764