[Review] 동물의 phylosymbiosis 및 이를 형성하게 하는 요인

내용 구성

• 이 논문에서는 동물의 어느 clade에서 phylosymbiosis가 관찰되는지 정리하였고,
• Phylosymbiosis의 driver를 host가 미치는 영향, microbes가 미치는 영향 2가지로 나눠서 설명하고 있다.
• Host가 미치는 영향에는 Vertical transmission, Horizontal transmission 등이 있고,
• Microbes가 미치는 영향에는 Niche construction, Priority effects 등이 있다.
• 일반적으로 phylosymbiosis는 taxonomically richer microbiomes에서 덜 발견되는데, 이는 richer microbiomes일수록 microbiome이 형성되는 데 있어 stochasticity가 높기 때문이라고 설명하였다.
• 또한 포유류의 경우에는 taxonomically richer microbiomes을 가지고 있지만, 일반적으로 phylosymbios를 보인다고 한다 (다른 대부분의 척추동물에서는 관찰이 되지 않음). 이는 포유류의 특성 (수유 등) 때문이라고 설명하였다.

 

참고

• Host dietary niche와 phylogeny (혹은 host ecology와 evolution) 중 어떤 것이 마이크로바이옴에 더 큰 영향을 미치는지 구분하여 따지는 자세를 넘어서야 한다고 주장한다. Host phylogeny가 특정 ecologies에 영향을 미치면서 동시에 마이크로바이옴을 형성하였다고 이해하는 것이 좋다고 한다 (키워드: versus, instead).
• Phylosymbiosis를 Figure 1a에서 도식으로 정리해뒀는데, 참고하면 개념을 이해하기 쉽다.
• Phylosymbiosis는 host phylogeny로 예측할 수 있는 microbiome composition의 패턴을 말하며, “microbial community relationships that recapitulate the phylogeny of their host”로도 정의된다 [참조].

 

Reference

• Mallott, E.K., Amato, K.R. Host specificity of the gut microbiome. Nat Rev Microbiol (2021). https://doi.org/10.1038/s41579-021-00562-3