정리
- Reanalysis를 위해 SRA나 MG-RAST에서 metagenomic data를 구할 수는 있지만 쉽지 않다: metadata가 엉망인 경우가 있기 때문.
- HumanMetagenomeDB는 69,822개 metagenomes의 metadata를 정리해두었다.
- 그래서 human metagenome을 얻고 싶다면 이 데이터베이스를 먼저 이용하여 필요한 것을 탐색하기 좋을 것 같다.
Reference
- Kasmanas, Jonas Coelho, et al. "HumanMetagenomeDB: a public repository of curated and standardized metadata for human metagenomes." Nucleic Acids Research 49.D1 (2021): D743-D750.
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