[Article] GIMICA: 사람과 microbiota와의 관계(증가, 감소)에 대한 데이터베이스

정리

• Host factors에는 host genetic factors (HGFs)와 host immune factors (HIFs)가 있다.
• GIMICA (Host Genetic and Immune Factors Shaping Human Microbiota)는 세균과 host factors와의 관계를 파악하기 위한 데이터베이스이다.
• 세균을 검색하면 이와 관련된 host factors에는 무엇이 있는지 알려준다: 예를 들어, Escherichia coli를 검색하면 VIPR2이 없을 때 Escherichia가 증가한다는 논문이 있다는 사실을 알 수 있다.
• 반대로 host factors를 검색했을 때 이와 관련된 세균도 보여준다.
• 데이터베이스를 만들 때는 각 세균이 human과 어떤 관련이 있는지 문헌 조사를 통해 확인하였다고 한다.
• 링크: https://idrblab.org/gimica/

 

Reference

• J. Tang, X. L. Wu, M. J. Mou, C. Wang, L. D. Wang, F. C. Li, M. Y. Guo, J. Y. Yin, W. Q. Xie, X. N. Wang, Y. X. Wang, Y. B. Ding*, W. W. Xue* & F. Zhu*. GIMICA: host genetic and immune factors shaping human microbiota. Nucleic Acids Research. 49(D1): 715-722 (2021). PMID: 33045729