[Article] 동물의 마이크로바이옴 구성은 동물의 진화와 관련이 있다 (Phylosymbiosis)

정리

• 이 연구는 여러 종에서 1) phylosymbiosis를 확인하고, 2) 그의 functional significance를 알아보았다.
• Phylosymbiosis: Host phylogeny와 microbiota dendrogram을 비교하여 phylosymbiosis를 확인할 수 있었다.
• Functional significance: Mice에 다른 종의 microbiome을 transplanting하였더니 소화 능력이 감소하였다 (selection on host–microbiota interactions가 phylosymbiosis를 가져옴).
• 참고) microbiota-based model은 높은 정확도로 host species origin을 예측하였다: OTU 데이터에 대해서 random forest classifier (RFC) supervised learning algorithm을 적용함

 

Reference

• Brooks, Andrew W., et al. "Phylosymbiosis: relationships and functional effects of microbial communities across host evolutionary history." PLoS biology 14.11 (2016): e2000225.