[Article] AmpliCI: 새로운 ASV method

정리

• Model에 대한 설명은 Materials and Methods에 수식과 함께 정리되어 있다 (이해 못함...)
• DADA2, Deblur, UNOISE3와 같은 ASV method로 개발된 방법인데, 위 3가지 방법보다 더 나은 퍼포먼스를 보인다고 소개함.
• UNOISE3와 Deblur는 quality information을 무시하는 반면, DADA2와 AmpliCI는 quality information을 사용한다.

 

Reference

• Peng, Xiyu, and Karin Dorman. "AmpliCI: a high-resolution model-based approach for denoising Illumina amplicon data." Bioinformatics (2020).